Στεγάζεται σε ένα Ενετικό,επιβλητικό, διώροφο, κτήριο στηνν Πλατεία Συντάγματος Το κτήριο κτίστηκε το 1713, κατά την περίοδο της Δεύτερης Ενετοκρατίας, από τον Προβλεπτή του στόλου Αυγουστίνο Σαγρέδο για να χρησιμοποιηθεί ως αποθήκη του στόλου. Πρόκειται για ένα από τα ωραιότερα και καλύτερα διατηρημένα μνημεία της εποχής της Ενετοκρατίας στην Ελλάδα. Πρόκειται για ένα κτίσμα, διαστάσεων 33,50μ. x 13,70μ. και ύψους 15,60μ.Η έκθεση εκτείνεται και στους δύο ορόφους ,σε αίθουσες ίδιας κάτοψης και διαστάσεων.. Στην αίθουσα του πρώτου ορόφου παρουσιάζονται τα ευρήματα των προϊστορικών χρόνων ενώ στην αίθουσα του δεύτερου ορόφου τα ευρήματα των ιστορικών χρόνων.Κορυφαίο έκθεμα του μουσείου αποτελεί η μυκηναϊκή πανοπλία των Δενδρών που χρονολογείται στα τέλη του 15ου αι. π.Χ. Πρόκειται για το λαμπρότερο και εντυπωσιακότερο δείγμα του αμυντικού οπλισμού των Μυκηναίων που διασώθηκε ως τις μέρες μας,για το οποίο μάλιστα υπάρχει και αναφορά από τον Όμηρο,στην Ιλιάδα.