Η ονομασία Αντιβουνιώτισσα προέρχεται από την θέση του ναού πάνω στο λόφο Αντιβούνι. Ο Ιερός Ναός Παναγίας Αντιβουνιώτισσας οικοδομήθηκε πιθανότατα τον 15ο αιώνα και θεωρείται από τους παλαιότερους της πόλης. Για να λειτουργήσει το Μουσείο, το οποίο εγκαινιάστηκε το 1984, κρίθηκε απαραίτητο να γίνουν διάφορες επεμβάσεις αναστήλωσης του ναού, οι οποίες ξεκίνησαν πριν τα εγκαίνια και ολοκληρώθηκαν το 1994. H Αντιβουνιώτισσα δεν έχασε ποτέ τον λατρευτικό της χαρακτήρα. Λειτουργείται σε Θεομητορικέςγιορτές δύο φορές τον χρόνο 23 Αυγούστου και 26 Δεκεμβρίου .Στη συλλογή του Μουσείου περιλαμβάνονται Βυζαντινά και Μεταβυζαντινά έργα των Εμμανουήλ Τζάννε, Μ Αβράμη, Νικ. Τζαφούρη, ΜιχαήλΔαμασκηνού, Στ. Τζανκαρόλα, Ι. Παλλαδά, Εμ. Λομπάρδου
