Το εκκλησιαστικό μουσείο βρίσκεται στο κέντρο της πόλης της Πάργας, ακριβώς πλάϊ από τον ενοριακό ναό των Αγίων Αποστόλων.Φιλοξενεί πολλά πολύτιμα αντικείμενα, όπως σπάνια βιβλία, ιερά Ευαγγέλια , εκκλησιαστικά είδη.Επίσης εκεί φυλάσσεται το λάβαρο της Πάργας, 300 χρόνων, από κόκκινο μετάξι ζωγραφισμένο με λάδι και από τις δύο πλευρές, όπου εικονίζονται η Παναγία και το θείο βρέφος με χρυσά άστρα. Επάνω στη σημαία διακρίνονται σημάδια από σφαίρες Τούρκων.