Στο κέντρο της πόλης βρίσκεται το αρχαιολογικό μουσείο της Κομοτηνής το οποίο θεωρείται ένα από τα πιο μοντέρνα της πόλης και εγκαινιάστηκε το 1976.Είναι έργο του αρχιτέκτονα Άρη Κωνσταντινίδη ,με χαρακτηριστικά στοιχεία του την γεωμετρική διάρθρωση των όγκων και των επιφανειών του ,τις ανισοϋψείς στέγες με φεγγίτες και παράθυρα, τα αίθρια, τα εσωτερικά και εξωτερικά υπόστεγα και τα παράθυρα με τις μεταλλικές περσίδες .Η παρουσίαση των εκθεμάτων γίνεται με χρονολογική ακολουθία από την Νεοληθική έως την Βυζαντινή περίοδο, χωρίς όμως τη διάσπαση των κατά τόπους ανασκαφικών συνόλων. Όλα τα εκθέματα αποκαλύπτουν την σημασία της παρουσίας των Ελλήνων στο βόρειο Αιγαίο και τη δημιουργική πορεία της ελληνικής τέχνης και του ελληνικού πολιτισμού σε μια απομακρυσμένη κατά την αρχαιότητα περιοχή του βορρά. Στα πιο εντυπωσιακά εκθέματα του, συγκαταλέγεται η χρυσή προτομή του Σεπτιμίου Σεβήρου (193-211 μ.Χ.) την οποία κρατούσαν στερεωμένη σε κοντάρι οι imaginiferi του ρωμαϊκού στρατού.